Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB11O95342 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms