Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPA1O75762 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPA1O75762 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms