Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF40O75150 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF40O75150 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF40O75150 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF40O75150 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF40O75150 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF40O75150 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF40O75150 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF40O75150 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF40O75150 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF40O75150 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RNF40O75150 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF40O75150 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms