Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUPR1O60356 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms