Protein–RNA interactions for Protein: O60343

TBC1D4, TBC1 domain family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D4O60343 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D4O60343 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D4O60343 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms