Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GATCO43716 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATCO43716 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATCO43716 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATCO43716 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATCO43716 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATCO43716 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
GATCO43716 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GATCO43716 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATCO43716 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms