Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ1O43426 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SYNJ1O43426 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms