Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA2O00451 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms