Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE2AO00408 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms