Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms