Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGB1P1B2RPK0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 331.5 ms