Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF25A6NGN4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF25A6NGN4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms