Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGPEP1LA6NFU8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms