Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HELTA6NFD8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms