Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB19A4D1S5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB19A4D1S5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms