Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ISPDA4D126 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ISPDA4D126 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ISPDA4D126 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISPDA4D126 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISPDA4D126 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ISPDA4D126 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms