Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6F4

TRBV21OR9-2, T-cell receptor beta variable 21/OR9-2 (pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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