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| PTPRJ | Q12913 | MIER1-207 | ENST00000371018 | 3875 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SSRP1-201 | ENST00000278412 | 2819 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC091198.1-201 | ENST00000591558 | 2492 nt | TSL 5 BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FHL2-204 | ENST00000393352 | 1426 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CCAR2-206 | ENST00000520861 | 3560 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MBTPS1-201 | ENST00000343411 | 4338 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | BCAR1-203 | ENST00000393422 | 4064 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RASAL1-201 | ENST00000261729 | 3382 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | TMEM18-202 | ENST00000355654 | 2376 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TIMM22-201 | ENST00000327158 | 3194 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PIK3R5-218 | ENST00000611902 | 4339 nt | TSL 5 BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAGEC3-201 | ENST00000298296 | 1932 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 12.79 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ELOC-210 | ENST00000622804 | 1976 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DYSF-202 | ENST00000394120 | 6543 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MST1R-201 | ENST00000296474 | 4536 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC243772.2-201 | ENST00000428289 | 3543 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MS4A14-209 | ENST00000531787 | 2537 nt | TSL 2 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HIST1H2BG-201 | ENST00000541790 | 1534 nt | APPRIS P1 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | G3BP2-201 | ENST00000357854 | 2609 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | CASQ2-201 | ENST00000261448 | 2674 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AOC3-201 | ENST00000308423 | 4026 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PRAMEF6-201 | ENST00000376189 | 1720 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PRAMEF6-202 | ENST00000415464 | 1720 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FER1L6-AS2-201 | ENST00000520031 | 1746 nt | TSL 2 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PRAMEF5-201 | ENST00000622421 | 1720 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | WDR47-203 | ENST00000369962 | 4199 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PCDHGA3-201 | ENST00000253812 | 4771 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ICE1-201 | ENST00000296564 | 7927 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ATP4A-201 | ENST00000262623 | 3709 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR193A-201 | ENST00000384882 | 88 nt | BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | ZFX-AS1-201 | ENST00000427551 | 417 nt | TSL 3 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL118511.2-201 | ENST00000436739 | 311 nt | TSL 3 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | LRRC75A-AS1-208 | ENST00000480811 | 968 nt | TSL 2 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PRDM2-214 | ENST00000505823 | 568 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC233724.7-201 | ENST00000511476 | 253 nt | BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARHGEF4-212 | ENST00000525839 | 3828 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC124301.2-201 | ENST00000529781 | 556 nt | TSL 2 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | snoZ6.3-201 | ENST00000583496 | 76 nt | BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP002478.2-201 | ENST00000584060 | 557 nt | TSL 4 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP001793.1-201 | ENST00000584733 | 839 nt | BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL365205.3-201 | ENST00000593368 | 169 nt | BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR6893-201 | ENST00000613458 | 69 nt | BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR6125-201 | ENST00000618986 | 96 nt | BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC080080.2-201 | ENST00000624307 | 590 nt | BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARL14EPL-203 | ENST00000634632 | 642 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC18A1-201 | ENST00000265808 | 2770 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC02211-203 | ENST00000642022 | 2816 nt | BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CDKL3-201 | ENST00000265334 | 2130 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC134407.3-201 | ENST00000624035 | 2139 nt | BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SRSF5-205 | ENST00000553635 | 1412 nt | TSL 2 BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ACVR1-207 | ENST00000434821 | 2861 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RALA-201 | ENST00000005257 | 2880 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PLEKHH1-201 | ENST00000329153 | 6604 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.78 | □□□□□ -0.36 | | |