Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX9Q9Y5X1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms