Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC12A4Q9UP95 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms