Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD2Q9UKL4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD2Q9UKL4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms