Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAX2Q9UIW0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms