Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms