Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SWAP70Q9UH65 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms