Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTI1BQ9UEU0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms