Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CFDP1Q9UEE9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CFDP1Q9UEE9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CFDP1Q9UEE9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms