Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXTL2Q9UBQ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXTL2Q9UBQ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms