Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms