Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms