Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms