Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms