Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2AIPQ9NXV6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2AIPQ9NXV6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms