Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
C1orf109Q9NX04 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf109Q9NX04 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms