Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC3Q9NUV7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms