Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CENPJQ9HC77 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms