Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms