Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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CEP44Q9C0F1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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CEP44Q9C0F1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP44Q9C0F1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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CEP44Q9C0F1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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CEP44Q9C0F1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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CEP44Q9C0F1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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CEP44Q9C0F1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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CEP44Q9C0F1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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CEP44Q9C0F1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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CEP44Q9C0F1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CEP44Q9C0F1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CEP44Q9C0F1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CEP44Q9C0F1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP44Q9C0F1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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