Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms