Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF4Q9BUZ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF4Q9BUZ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms