Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD7Q9BUK0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms