Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms