Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU2

TCEAL7, Transcription elongation factor A protein-like 7, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL7Q9BRU2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCEAL7Q9BRU2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCEAL7Q9BRU2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms