Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC77Q9BR77 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms