Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF25Q9BQ70 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms