Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C19orf43Q9BQ61 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C19orf43Q9BQ61 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms