Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RMDN3Q96TC7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms