Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A9Q96Q91 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A9Q96Q91 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A9Q96Q91 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms