Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85AQ96PX6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85AQ96PX6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms