Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZIM3Q96PE6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIM3Q96PE6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIM3Q96PE6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIM3Q96PE6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIM3Q96PE6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms