Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COG8Q96MW5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms